Ubicados en las alas oriental y occidental del Palacio, este conjunto de estancias fueron diseñadas para albergar las habitaciones y salas de los hijos de los reyes ecuatorianos. Con un total de dieciséis habitaciones que podían ser combinadas de acuerdo a las necesidades de la familia real de turno, las occidentales eran ocupadas por los príncipes, y las orientales por las princesas. Por otro lado, las decoraciones de cada recámara respondía a los gustos de sus diferentes ocupantes en distintas épocas; por ello, y para fines museísticos, en la actualidad muestran algunas de las más recordadas, como el Apartamento Chino de la princesa María Cristina de Cotopaxi, antes de su matrimonio con el Duque de Penthievre en 1873.